Університет є єдиним базовим закладом вищої освіти Міністерства фінансів України. Відомча підпорядкованість зумовлює основні напрями наукових досліджень, які відображаються у наступній науковій тематиці:

• державні запозичення в системі публічних фінансів;
• системи експрес-експертизи і підтримки рішень на основі методів та засобів штучного інтелекту у цифровій економіці України;
• використання інтелектуальних технологій в аналізі економічних ризиків регіонів України та країн V4;
• організаційно-правові, інформаційно-аналітичні та оперативно-розшукові засади забезпечення економічної безпеки держави;
• правове забезпечення охорони і захисту митних та фінансових інтересів держави: сучасні виклики та шляхи їх подолання;
• правоохоронна діяльність: доктринальні та практичні концепції в умовах оновлення парадигми суспільної безпеки;
• концептуальні засади реформування митної системи України в умовах посилення інтеграційних процесів;
• підприємництво в епоху глобальних трансформацій: виклики та перспективи розвитку;
• сучасні тренди податкової політики;
• обліково-інформаційні інструменти управління в активізації розвитку субєктів господарювання;
• обліково-аналітичне забезпечення управління субєктів господарювання в умовах сталого розвитку;
• організаційно-економічний механізм протидії тіньовій економіці та корупції;
• економіка міст, регіонів, територіальних громад: способи відновлення в пілявоєнний період;
• теоретичні засади підвищення ефективності кримінально-правового, кримінологічного та кримінально-виконавчого запобігання злочинності;
• розслідування кримінальних праовопорушень (кримінальні, процесуальні та криміналістичні аспекти);
• цивільно-правовий захист прав людини у соціальній державі;
• правове регулювання публічної фінансової діяльності;
• формування кроскультурних компетенцій у здобувачів вищої освіти гуманітарних спеціальностей: мовний та медійний аспекти;
• соціалізація особистості в умовах кризового суспільства: психолого-педагогічний аспект.

У структурі Університету функціонує Науково-дослідний інститут фінансової політики, який у 2023 році виконує наступну наукову тематику:

• створення в Україні «сухих портів» як альтернативи контейнерному товарообігу через пункти пропуску на державному кордоні для морського сполучення;
• нaцioнaльний аспект взаємної aдмiнiстрaтивнoї допомоги в paмкaх Конвенції пpo пpoцедypy спiльногo тpaнзитy;
• створення інноваційної системи підвищення кваліфікації у сфері бухгалтерського обліку в установах і організаціях державного сектору.