Підготовка наукових кадрів в аспірантурі, докторантурі вважається стратегічним завданням та є одним з основних джерел постійного поповнення й оновлення інтелектуального потенціалу держави, її наукової еліти в цілому.

З метою організації та управління на загальноуніверситетському рівні процесів підготовки здобувачів вищої освіти ступеня доктора філософії та доктора наук в Державному податковому університеті діє відділ аспірантури, докторантури.

У своїй роботі даний структурний підрозділ  керується системою організаційно-освітньо-наукового забезпечення підготовки здобувачів ступеня доктора філософії на третьому (освітньо-науковому) рівні вищої освіти та доктора наук, безпосередньо підпорядковується проректору з наукової роботи, підзвітний та підконтрольний ректору університету.

За роки свого існування університет підготував багато вчених-економістів, юристів. Відділ аспірантури, докторантури в університеті започатковано в 1996 році.

Відділ аспірантури, докторантури реалізує завдання щодо створення умов безперервної освіти, підвищення науково-педагогічної і наукової кваліфікації громадян.

Профіль підготовки аспірантів та докторантів відповідає пріоритетним напрямам наукової діяльності університету та фактично охоплює всі напрями, за якими в університеті здійснюється підготовка фахівців за відповідними освітньо-кваліфікаційними рівнями.

Університет провадить підготовку аспірантів для отримання наукового ступеня доктор філософії за спеціальностями:

• C1 Економіка та міжнародні економічні відносини (за спеціалізаціями) ( 051 Економіка)
• D1 Облік і оподаткування (071 Облік і оподаткування)
• D2 Фінанси, банківська справа, страхування та фондовий ринок (072 Фінанси, банківська справа, страхування та фондовий ринок)
• D4 Публічне управління та адміністрування (281 Публічне управління та адміністрування)
• D8 Право (081 Право)
• D9 Міжнародне право (293 Міжнародне право)

Підготовка в аспірантурі, докторантурі здійснюється:

• за рахунок видатків державного бюджету;
• за рахунок коштів юридичних та/або фізичних осіб.

Відділ аспірантури, докторантури Державного податкового університету здійснює організацію, планування, супровід освітньо-наукових програм здобуття наукового ступеня доктора філософії, доктора наук.

Для успішної роботи над проведенням наукових досліджень для аспірантів та докторантів в університеті створені всі необхідні умови, зокрема сучасна матеріально-технічна база, висококваліфіковані науково-педагогічні та наукові кадри, власна видавнича база.